利用微波能穿透被加工食品的热效应和非热效应，可分别对各类含水食品药材药丸（药片）进行加热、干燥、脱水、解冻与灭菌。比传统食品加工，微波处理具有下列优点：
? 加热迅速。传统的加热方法是利用物质的传热系数，从外到内进行热量传递，而微波则对含水物质内外同时作用。因此加热均匀迅速，节省能源与处理时间。
? 由于微波加热迅速，食物内的营养、叶绿素、维生素可获得更良好的保存。同时，肌浆含量和肌纤维含量的变化也轻微，脂肪含量相对的减少。
? 由于微波能穿透一定厚度的物质进行处理，微波干燥、脱水的效率是传统方法的几倍至几十倍。与此同时，它不破坏物质原有的营养成分、色泽和风味。
? 微波处理物质的同时也对物质进行灭菌防霉。利用微波的非热效应（生物效应），可在相对低温下，对物质进行迅速的灭菌处理，大大延长物质的保存期和减少对防腐剂的依赖。